L-isem tal-belt litteralment ifisser “żebbuġ” bil-Malti; ġejja mill-imsaġar kbar taż-żebbuġ li kien hemm ġewwa u madwar il-post attwali tal-knisja u ċ-ċentru tal-belt. Il-belt ingħatat it-titlu ta’ Città Rohan mill-Granmastru Emmanuel de Rohan-Polduc fl-1777. Bħal f’dan it-tip ta’ avvenimenti, ir-residenti ta’ Ħaż-Żebbuġ bnew arkata fl-entratura tal-belt biex jimmarkaw l-istatus tagħha bħala belt. Il-bieb, magħruf min-nies tal-lokal bħala “Il-Bieb il-Ġdid” jew il-Bieb il-Ġdid għadu sal-lum.
Fl-1380 inbniet knisja ddedikata lil San Filep ta’ Agira f’Casal Zebugi, medda ta’ art li tinsab f’nofs il-komunitajiet żgħar li kienu żviluppaw matul l-okkupazzjoni Għarbija preċedenti ta’ Malta, jiġifieri Ħal Dwin, Ħal Muxi u Ħal Mula u li eventwalment ġew magħqudin flimkien u ffurmaw ir-raħal magħruf sal-lum bħala Ħaż-Żebbuġ. Il-knisja parrokkjali, iddisinjata minn Tumas Dingli, inbniet lejn l-aħħar tas-seklu sbatax minflok knisja aktar antika. L-istatwa ta’ San Filep, tal-iskultur Luigi Fontana, inħolqot fl-1864.
Malta hija għanja ħafna fi fdalijiet arkeoloġiċi u Ħaż-Żebbuġ mhux eċċezzjoni. Ta ismu liż–żmien preistoriku meta kien instab fuħħar ta’ tip mhux magħruf s’issa fl-oqbra fiż-żona magħrufa bħala Ta’ Trapna. Aktar tard sejbiet arkeoloġiċi nbnew madwar l-istess żmien fejn saru sussegwentement magħrufa bħala “fażi ta’ Ħaż-Żebbuġ”. Instab ukoll tifrix ta’ oqbra Puniċi u Feniċi flimkien ma’ numru żgħir ta’ karretti u fdalijiet oħra.